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上海口岸检出中国首例库波热病毒

幼香亭

 

 

  上海3月24日电 (记者 陈静)上海出入境检验检疫局24日披露,该局对1例来自安哥拉疑似感染黄热病中国籍人员的样本全基因组进行测序分析,检出了库波热病毒(Ekpoma virus)。该病毒为中国首次检出,全球第2次发现。

  据了解,库波热病毒(Ekpoma virus)是2015年在西非尼日利亚新发现的病毒,分1型(EKV1)和2型(EKV2)两个亚型,主要感染牛,媒介为库蠓,全球仅有1次报道。同时该病毒与另外一种引起出血热病死率高的下刚果热病毒(Bas-congovirus)高度同源,且因病例少,病源生物形状不明。

  2017年1月1日,国家质检总局境外传染病监测哨点报告一名来自安哥拉的疑似感染黄热病人员即将回国治疗。上海出入境检验检疫局立即启动口岸突发公共卫生事件应急处置预案,对入境该名疑似病例及其密切接触者开展流行病学调查、医学排查、采集样本检测。

  经上海检验检疫局卫生检疫中心实验室与广东局P3实验室检测比对,均排除了黄热病毒、裂谷热病毒、基孔肯雅病毒、登革病毒、疟原虫等多种虫媒病原体感染和甲乙型流感病毒、肝炎病毒等病原体感染。

  为进一步查明发热原因,上海出入境检验检疫局联合中国军事医学科学院运用宏基因组测序技术,检测分析发现一片段序列与库波热病毒(Ekpoma virus)同源性高达96.5%。其后联合江苏出入境检验检疫局赶赴南通,开展后续追踪调查,采集样本进行了全基因测序,于2月21日得到病毒全基因组。该病毒基因组全长为12639bp,经序列比对,发现与尼日利亚的库波热病毒2型(EKV2)同源性为96%。进一步做病毒序列进化树分析,最终确认该病毒为库波热病毒(Ekpoma virus)。

  此次案例的流行病学调查表明,该病毒在体内携带时间长达3周以上,而在中国存在该病的传播媒介——库蠓,且分布种类多、地区广,需要对其分布和携带病原情况开展进一步的调查。今后,检验检疫部门将进一步关注其生物学性状和致病机制的研究。目前上海出入境检验检疫局已根据库波热病毒(Ekpoma virus)基因序列,建立了相关快速检测方法,为该病毒病的防控和诊断试剂的研发打下基础。

  近年来,国际重大疫情频发,上海出入境检验检疫局不断优化口岸检疫模式,与上海市卫计委、中国军事医学科学院、各口岸部门等单位通力合作,不断完善“疫情风险评估、口岸检疫查验、实验室检测、后续追踪”全链条口岸防控体系,持续提升上海口岸突发公共卫生事件应对能力,在口岸疫情防控和维护国家公共卫生安全方面发挥着重要作用。(完)

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